В августе 2012 года Беломорский район сильно пострадал в результате сильнейших ливней и последовавшего за ними наводнения. Под ударом стихии оказалась и Маткожненская ГЭС, которая была частично разрушена, без электроснабжения на какое-то время остался посёлок Сосновец.
Виталий Козлов, директор Каскада Выгских ГЭС ОАО «ТГК-1», рассказал Александру Худилайнену об этапах восстановления станции. По его словам, в критические моменты общее число занятых на восстановлении ГЭС работников превышало 100 человек.
«В течение полугода мы осуществили большой объем ремонтно-восстановительных работ на основном и вспомогательном оборудовании, гидротехнических сооружениях и помещениях станции. Была восстановлена работоспособность трех гидроагрегатов, включая их вспомогательные системы, проведены строительные работы на пристанционной площадке и здании станции, восстановлена электрическая схема и собственные нужды ГЭС, – сообщил Виталий Козлов. – 27 сентября 2012 года на холостой ход был пущен первый восстановленный гидроагрегат; в ноябре – второй и принята в эксплуатацию плотина Маткожненского ручья. Все работы выполнены в полном объеме и в установленный срок».
Глава региона остался доволен увиденным. «Из всех таких ситуаций надо извлекать уроки. И на примере Маткожненской ГЭС мы видим, что урок извлекли. Я надеюсь, что это станет примером для других станций на территории Карелии. В прошлом году здесь в минимальные сроки было обесточено и выключено все оборудование, и самое главное, не допустили человеческих жертв».
В настоящее время Маткожненская ГЭС работает в штатном режиме.